Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms