Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TNPO1Q92973 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TNPO1Q92973 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNPO1Q92973 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms