Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNRQ92752 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNRQ92752 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNRQ92752 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNRQ92752 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNRQ92752 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNRQ92752 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNRQ92752 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNRQ92752 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNRQ92752 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNRQ92752 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNRQ92752 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNRQ92752 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNRQ92752 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNRQ92752 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TNRQ92752 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TNRQ92752 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TNRQ92752 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNRQ92752 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNRQ92752 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNRQ92752 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNRQ92752 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNRQ92752 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNRQ92752 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNRQ92752 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNRQ92752 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNRQ92752 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNRQ92752 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNRQ92752 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNRQ92752 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNRQ92752 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNRQ92752 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNRQ92752 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TNRQ92752 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TNRQ92752 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNRQ92752 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNRQ92752 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNRQ92752 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNRQ92752 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNRQ92752 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TNRQ92752 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNRQ92752 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNRQ92752 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNRQ92752 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNRQ92752 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNRQ92752 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNRQ92752 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNRQ92752 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNRQ92752 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNRQ92752 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNRQ92752 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNRQ92752 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNRQ92752 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
TNRQ92752 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TNRQ92752 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TNRQ92752 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TNRQ92752 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNRQ92752 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TNRQ92752 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TNRQ92752 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNRQ92752 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNRQ92752 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNRQ92752 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNRQ92752 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNRQ92752 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNRQ92752 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNRQ92752 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNRQ92752 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNRQ92752 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNRQ92752 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNRQ92752 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNRQ92752 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNRQ92752 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNRQ92752 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNRQ92752 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNRQ92752 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TNRQ92752 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNRQ92752 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNRQ92752 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNRQ92752 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNRQ92752 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNRQ92752 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNRQ92752 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TNRQ92752 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TNRQ92752 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNRQ92752 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNRQ92752 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNRQ92752 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNRQ92752 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNRQ92752 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNRQ92752 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TNRQ92752 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNRQ92752 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TNRQ92752 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNRQ92752 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNRQ92752 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNRQ92752 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNRQ92752 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNRQ92752 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNRQ92752 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms