Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRUQ92729 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms