Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3AQ92664 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms