Protein–RNA interactions for Protein: Q92618

ZNF516, Zinc finger protein 516, humanhuman

Predictions only

Length 1,163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF516Q92618 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZNF516Q92618 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms