Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms