Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PALLDQ8WX93 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PALLDQ8WX93 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PALLDQ8WX93 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PALLDQ8WX93 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PALLDQ8WX93 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PALLDQ8WX93 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PALLDQ8WX93 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PALLDQ8WX93 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PALLDQ8WX93 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PALLDQ8WX93 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PALLDQ8WX93 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PALLDQ8WX93 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PALLDQ8WX93 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PALLDQ8WX93 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PALLDQ8WX93 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PALLDQ8WX93 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PALLDQ8WX93 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALLDQ8WX93 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALLDQ8WX93 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALLDQ8WX93 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALLDQ8WX93 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALLDQ8WX93 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALLDQ8WX93 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALLDQ8WX93 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALLDQ8WX93 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALLDQ8WX93 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PALLDQ8WX93 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALLDQ8WX93 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALLDQ8WX93 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALLDQ8WX93 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PALLDQ8WX93 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALLDQ8WX93 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALLDQ8WX93 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALLDQ8WX93 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALLDQ8WX93 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALLDQ8WX93 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
PALLDQ8WX93 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALLDQ8WX93 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms