Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVD5

RNF141, RING finger protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF141Q8WVD5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF141Q8WVD5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms