Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D1Q8WV19 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms