Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP35Q8NFH5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms