Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms