Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms