Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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