Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z9

VSIG10, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10Q8N0Z9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VSIG10Q8N0Z9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSIG10Q8N0Z9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSIG10Q8N0Z9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSIG10Q8N0Z9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSIG10Q8N0Z9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSIG10Q8N0Z9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSIG10Q8N0Z9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSIG10Q8N0Z9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSIG10Q8N0Z9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSIG10Q8N0Z9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSIG10Q8N0Z9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSIG10Q8N0Z9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSIG10Q8N0Z9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSIG10Q8N0Z9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSIG10Q8N0Z9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSIG10Q8N0Z9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSIG10Q8N0Z9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSIG10Q8N0Z9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSIG10Q8N0Z9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSIG10Q8N0Z9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSIG10Q8N0Z9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSIG10Q8N0Z9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSIG10Q8N0Z9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSIG10Q8N0Z9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSIG10Q8N0Z9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSIG10Q8N0Z9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSIG10Q8N0Z9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms