Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC6Q8IVU3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms