Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUF1

CBWD2, COBW domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBWD2Q8IUF1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CBWD2Q8IUF1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBWD2Q8IUF1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBWD2Q8IUF1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBWD2Q8IUF1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBWD2Q8IUF1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBWD2Q8IUF1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBWD2Q8IUF1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBWD2Q8IUF1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBWD2Q8IUF1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBWD2Q8IUF1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBWD2Q8IUF1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBWD2Q8IUF1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBWD2Q8IUF1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBWD2Q8IUF1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBWD2Q8IUF1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBWD2Q8IUF1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBWD2Q8IUF1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms