Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
KNDC1Q76NI1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms