Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC73Q6ZRK6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms