Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms