Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms