Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms