Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms