Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGMBQ6NW40 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms