Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms