Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms