Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
WSCD1Q658N2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms