Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG87

PAPD7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPD7Q5XG87 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAPD7Q5XG87 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAPD7Q5XG87 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAPD7Q5XG87 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAPD7Q5XG87 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAPD7Q5XG87 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAPD7Q5XG87 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAPD7Q5XG87 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PAPD7Q5XG87 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PAPD7Q5XG87 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PAPD7Q5XG87 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAPD7Q5XG87 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAPD7Q5XG87 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PAPD7Q5XG87 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAPD7Q5XG87 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PAPD7Q5XG87 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PAPD7Q5XG87 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PAPD7Q5XG87 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAPD7Q5XG87 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAPD7Q5XG87 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PAPD7Q5XG87 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PAPD7Q5XG87 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PAPD7Q5XG87 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PAPD7Q5XG87 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAPD7Q5XG87 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAPD7Q5XG87 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.27■■□□□ 1
PAPD7Q5XG87 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PAPD7Q5XG87 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPD7Q5XG87 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms