Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms