Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RPRD2Q5VT52 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
RPRD2Q5VT52 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RPRD2Q5VT52 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RPRD2Q5VT52 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
RPRD2Q5VT52 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RPRD2Q5VT52 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RPRD2Q5VT52 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RPRD2Q5VT52 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RPRD2Q5VT52 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RPRD2Q5VT52 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RPRD2Q5VT52 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RPRD2Q5VT52 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RPRD2Q5VT52 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RPRD2Q5VT52 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RPRD2Q5VT52 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RPRD2Q5VT52 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RPRD2Q5VT52 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RPRD2Q5VT52 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RPRD2Q5VT52 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RPRD2Q5VT52 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RPRD2Q5VT52 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RPRD2Q5VT52 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RPRD2Q5VT52 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RPRD2Q5VT52 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RPRD2Q5VT52 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RPRD2Q5VT52 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RPRD2Q5VT52 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
RPRD2Q5VT52 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms