Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYT6Q5T7P8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms