Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms