Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms