Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms