Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF628Q5EBL2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms