Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms