Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms