Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXF1

FAM74A3, Putative protein FAM74A3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A3Q4VXF1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM74A3Q4VXF1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM74A3Q4VXF1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms