Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRY2Q49AN0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRY2Q49AN0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRY2Q49AN0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRY2Q49AN0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRY2Q49AN0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRY2Q49AN0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRY2Q49AN0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CRY2Q49AN0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRY2Q49AN0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CRY2Q49AN0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRY2Q49AN0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRY2Q49AN0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRY2Q49AN0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRY2Q49AN0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRY2Q49AN0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRY2Q49AN0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRY2Q49AN0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CRY2Q49AN0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CRY2Q49AN0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRY2Q49AN0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CRY2Q49AN0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRY2Q49AN0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRY2Q49AN0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRY2Q49AN0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRY2Q49AN0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CRY2Q49AN0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRY2Q49AN0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRY2Q49AN0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRY2Q49AN0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRY2Q49AN0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRY2Q49AN0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRY2Q49AN0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRY2Q49AN0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRY2Q49AN0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRY2Q49AN0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRY2Q49AN0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRY2Q49AN0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms