Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms