Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms