Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD55Q3KP44 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms