Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NBPF8Q3BBV2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NBPF8Q3BBV2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NBPF8Q3BBV2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NBPF8Q3BBV2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NBPF8Q3BBV2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NBPF8Q3BBV2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NBPF8Q3BBV2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NBPF8Q3BBV2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NBPF8Q3BBV2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NBPF8Q3BBV2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NBPF8Q3BBV2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NBPF8Q3BBV2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NBPF8Q3BBV2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NBPF8Q3BBV2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NBPF8Q3BBV2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NBPF8Q3BBV2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NBPF8Q3BBV2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NBPF8Q3BBV2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NBPF8Q3BBV2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NBPF8Q3BBV2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NBPF8Q3BBV2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NBPF8Q3BBV2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NBPF8Q3BBV2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NBPF8Q3BBV2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NBPF8Q3BBV2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NBPF8Q3BBV2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NBPF8Q3BBV2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NBPF8Q3BBV2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NBPF8Q3BBV2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NBPF8Q3BBV2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NBPF8Q3BBV2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NBPF8Q3BBV2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms