Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NBPF1Q3BBV0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NBPF1Q3BBV0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms