Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms