Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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