Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDK4Q16654 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms