Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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