Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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