Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms